为使玻璃器皿达到无菌状态，必须进行灭菌。一般以干热灭菌为主，如果用高压蒸气灭菌，灭菌后则要经过干燥才可使用。具体的灭菌方法详见本章第一节。这里只介绍几种常用玻璃器皿灭菌前的准备。

(1)培养皿洗净后应烘干或晾干，然后按每5-7套用牛皮纸或报纸包好，也可装在大饭盒或特制的盒内，即可进行灭菌；

(2)移液管洗净后也应烘干或晾干，在口吸的一端用尖头慑子或针塞人少许脱脂棉花，以防菌体吸人口中或口中的微生物吹人吸管而进人培养基内造成污染。

塞棉花要适量（长约1厘米，松紧适度），塞好后用酒精灯火焰将外露在管口的棉花烧除，然后用4-5厘米的报纸条，以45°角螺旋形将每根移液管分别卷好（要注意吸管的两端不可外露，特别是管尖处纸要加厚），标上量，再根据需要若干支扎成一束，即可灭菌。使用时可从移液中间拧断纸条抽取。

滴管灭菌前的包装与移液管相同，更应注意保护尖端，以防灭菌后再污染或折断；(3)试管和三角瓶如需要灭菌，在灭菌前要在管口和瓶口加上棉塞，再用报纸包好。试管也可若干支扎在一起，棉塞外包一层牛皮纸。如果采用高压蒸气锅单独对玻璃器皿进行灭菌，灭菌结束加热后，要立即排尽蒸气，打开锅盖，再将锅内剩余的水倒出，然后利用锅内的余热将器皿烘干。